9 февраля 1923 года Совет труда и обороны принял постановление «О возложении технического надзора за воздушными линиями на Главное управление воздушного флота и об организации Совета по гражданской авиации». Эта дата считается днём рождения гражданской авиации, которая 9 февраля отпразднует свой юбилей. 
История аэропорта города Зеи является неотъемлемой частью истории гражданской авиации Российской Федерации.
В 1933 году в областном центре организовался отряд самолетов ПО-2, созданный под руководством Николая Поликарпова, которые совершали пассажирские и почтовые перевозки в районные центры Амурской области. Труднодоступные северные районы области с неразвитой транспортной структурой, как никто другой нуждались именно в обеспечении воздушной системы.
1936 год, открыты аэродромы в Дамбуках, Зее и Тыгде.
В 1938 году назрел вопрос о строительстве аэропорта в северной окраине города Зеи. Аэропорты малых воздушных авиалиний мало чем походили на современные аэропорты. Площадка размером 300х400м для самолетов ПО-2, здание аэровокзала, стоянки-вот и все, что наименовалось аэропортом.
Первым начальником зейского аэропорта назначен человек с оригинальной фамилией – А. Е. Некогда, командиром звена Афанасьев.
Одновременно в поселке Ясном для снабжения отдаленных золотодобывающих приисков, было организовано звено самолетов ПО-2 из 15-и самолетов. Командиром звена был назначен П.П. Петренко. Работа аэропортов была бесперебойной, т.к они обеспечивали всем необходимым прииски Дамбуки, Октябрьский и Ясный. Работы для летчиков и техников было много. Если в Дамбуках была площадка, то в Бомнаке приходилось зимой садиться на лед, а летом грузы и почту сбрасывать с воздуха на землю.
1941 год, грянула Великая Отечественная война. Многих летчиков призвали в армию, но аэропорт продолжал работу. В 1942 г. начальником аэропорта был назначен Василий Иванович Евтушенко, вернувшийся с фронта после тяжелого ранения. (В этой должности он проработал 36 лет из общих 44-х, отработанных в авиации.
Слева направо: П.М. Пасечный, Б. Кутузов, В.С. Харченко, В.Г. Васильев, Г. Руденко, В.И. Евтушенко, Коваленко. Фотокопия 1948 г.
Нехитрое хозяйство, переданное под его начало составлял небольшой домик и «тепляк для самолетов». Несмотря на тяжёлые условия, он находил средства, тем самым расширяя материальную базу аэропорта. За два года было построено Здание радиостанции, метеостанции и гараж, летчики работали до изнеможения. Все для фронта — все для Победы….
Основными помощниками Василия Ивановича были: Владимир Сидорович Харченко — старший техник, автомеханики: Дорощенко, Кутузов и Панусов.
В 1944 г., летное поле было расширено до размеров 1000х300 метров, в результате чего здесь могли садиться все типы самолетов того времени. В послевоенное время развитие авиации шло быстрыми темпами, и Зейский аэропорт превратился в важнейшую воздушную гавань Амурской области. Для обеспечения потребностей народного хозяйства использовались не только маленькие По-2, но и флагман Аэрофлота того времени самолет ЛИ-2, объем пассажирских перевозок составлял 3-5 тыс. человек в год.
Слева направо: К.И. Панусов, П.А. Никитин, В. Губарев, П.М. Пасечный, Н.А. Татаринцев. Фотокопия 1949 г.
В начале 50-х гг. развитие аэрофлота было стремительным. На местные воздушные авиалинии вышли самолеты АН-2. Один из таких получил Зейский аэропорт. Командиром звена был Константин Владимирович Стрелков, который проработал в Зейском аэропорту до 1979 года.
Слева направо группа авиатехников: П.А. Никитин, Я.И. Тесленко, И.И. Калиненко, В. Демьяненко, П.М. Пасечный. Фотокопия 1950 г.

Слева направо: П.М. Пасечный и П.А. Никитин. Фотокопия 70-х гг.
Объем перевозок увеличивался с каждым годом. Теперь уже с аэропорта Зеи было налажено прямое сообщение с городами Благовещенск, Свободный, Хабаровск (рейсы совершал Ил-14).

Аэропорт «Зея». Фотокопия 1953 г.
В 1964 году по решению Партии развернулось строительство Зейской ГЭС, и старый аэропорт уже не мог удовлетворить возросших требований, нужен был новый аэропорт с искусственной взлетной полосой.
Строить новый аэропорт в черте города было нельзя, поэтому принято решение развернуть строительство нового аэропортового комплекса на берегу реки Зеи в 12 км от города. В 1969 году новый аэропорт начал осуществлять полеты. Комфортабельный ЯК-40 связал город Зею с Благовещенском. В течение 10 лет аэропорт Зея развивался стремительными темпами. По маршрутам Хабаровск, Благовещенск, Тында, Чегдомын, Чита, Иркутск пассажирские перевозки осуществлял самолет ЯК-40. В аэропорту Зея и приписных к нему аэропортах на тот момент работало 262 человека.
Встреча делегации в аэропорту «Зея». Фотокопия 1970 г.
В июне 1978 г. во главе порта становится Анатолий Петрович Васильев. Наступает бум авиационных перевозок. Ежегодно обслуживается до 100 тысяч пассажиров, перерабатывается более 5 тысяч тонн грузов и 300 тонн почты.
А. П. Васильев. Фотокопия 1980 г.
1980 г. началось строительство аэровокзального комплекса и удлинение взлётно-посадочной полосы (ВПП), длина которой составила 1650 м. В 1987 году новое здание аэровокзала начинает свою работу.
С 1990 г. начальником аэропорта Зея становится Сергей Маркович Чигрин, который внес значительный личный вклад в обеспечение технической готовности подведомственных муниципальных аэропортов Зейского района и координацию их работы.
С.М. Чигрин. Фотокопия 2000 г.
Аэропорт строился и развивался, но с наступлением эпохи реформ настала пора длительного затишья, т.к. большим спросом у населения пользовалась железная дорога. 
На посадку! Фотокопия 1978 г.
Наступили тяжёлые времена, но борьба за сохранение предприятия не угасала.
Сотрудники аэропорта «Зея». Фотокопия 1980-х г.

Коллектив аэропорта «Зея». Фотокопия 1980 г.

Женский коллектив отдела перевозок. Фотокопия 1980 г.
В 1997 году создаётся МУП «Аэропорт «Зея», в состав которого вошли базовый Зейский аэропорт и 7 приписных аэродромов в северных посёлках района. Функционирование нового предприятия поддерживается благодаря администрации города, т.к. содержание его было дорогим. Тем не менее, создаётся необходимость вылетов, частотой 3-4 раза в месяц т.к. некоторые населённые пункты отрезаны от мира из-за разливных рек. Многие сотрудники выполняют обязанности, возлагавшиеся ранее на двоих, а то и на троих.
Коллектив аэропорта «Зея». Фотокопия 90-х гг.
В 2006 году руководство Амурской области предложило Сергею Макаровичу возглавить всю оставшуюся группу малых аэропортов области: Зея, Тында, Экимчан, Береговой, Хвойный, Горный, Бомнак, Октябрьский и Февральск в форме Государственного учреждения Амурской области. Директором аэропорта «Зея» назначили Александра Тафатулина, который проработал в этой должности до 2018 г., после чего ушел на пенсию.
А.Ф. Тафатулин. Фотокопия 2016 г.
Спустя время возобновляются социально значимые рейсы в Береговой, Хвойный, Бомнак, Октябрьский а так же рейсы Благовещенск – Зея – Тында.
В 2012 году аэропорт «Зея» вошёл в состав федерального казённого предприятия «Аэропорты Приамурья».
А. Э. Якомас, руководитель аэропорта «Зея». Фотокопия 2000-х гг.
В настоящее время руководителем аэропорт «Зея» является Альберт Эдуардович Якомас, который занимает эту должность с 2018 года. Аэропорт «Зея» является составной частью системы гражданской авиации. Из аэропорта выполняются рейсы в города Благовещенск, Хабаровск, Иркутск и другие населённые пункты. Осуществляется прием воздушных судов типа Ан-2, Ан-3, Ан-28, Л-410, Cessna-208, Ан-24, Як-40, Ан-38, Ан-26, Ан-30, Ан-32, Ан-72, Ан-74, Falkon F-900, DHC8-300, DHC8-400, АН-148, а также вертолетов всех типов в дневное время суток.